يعنى قسم الكوارث بمساعدة الفئات الأشد ضعفاً والفئات المتضررة في المجتمع جراء الكوارث الطبيعية وغير الطبيعية . ويقوم قسم الكوارث بعمل استبيان لأعداد العوائل الاشد ضعفاً في المجتمع بغية تقديم المساعدات المطلوبة لها، والتي تشتمل على مساعدات عينية غذائية وإغاثية، حيث تقوم الهلال الاحمر العراقي سنوياً بتخصيص موازنة خاصة للمواد الغذائية وتوزيعها على المستفيدين، وكذلك تقديم الخدمات الاغاثية خلال المناسبات الدينية والأعياد الوطنية، واقامة المخيمات للاجئين والنازحين في حالات الطوارئ . ويطمح القسم إلى تغطية كافة الفئات المتضررة في المجتمع (الارامل ، الايتام ، المسنين ، المشردين ، المعوقين….الخ) من خلال تلبية الاحتياجات الاساسية لهم من مأكل ومشرب ومأوى من خلال تنفيذ برامج الحد من المخاطر ومشاركة القسم في المناسبات الوطنية لكي يكون هناك دور فعّال لجمعية الهلال الاحمر العراقي في المجتمع، بالإضافة الى الاستجابة الفعّالة والسريعة في حالات الكوارث الطبيعية كالفيضانات والكوارث التي من صنع الانسان كالانفجارات . ويكون هذا القسم ملتزم بتنفيذ كافة المهام الموكل بها بصفته قسم فعّال في الجمعيةوالالتزام بالضوابط التي تعمل بها الجمعية والخاصة بتوزيع المساعدات بالإضافة الى الالتزام بالمبادئ السبعة للجمعية الخاصة بالعمل في المجال الإنساني .